More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1306 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  49.71 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  48.24 
 
 		 196 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  48.24 
 
 		 196 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  44.05 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  39.88 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  37.08 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.47 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  38.15 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  36.63 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  36.36 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  38.46 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  35.5 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  37.5 
 
 		 177 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  38.01 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  34.5 
 
 		 176 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  35.23 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.81 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.48 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  37.08 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.56 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  33.15 
 
 		 191 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.86 
 
 		 181 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  36.93 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  40.57 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  30.6 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.36 
 
 		 174 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  40 
 
 		 177 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  38.98 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  38.98 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  38.98 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  38.98 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  39.31 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  35.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  35.84 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  35.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  35.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  32.78 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.02 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  38.86 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.23 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2536  cytochrome B561  37.97 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  30.81 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  34.68 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.72 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  32.54 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  32.54 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  39.01 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.54 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.54 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.33 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.54 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  31.95 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.18 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  29.44 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  33.54 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.76 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.95 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.14 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  32.24 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.03 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  32.95 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.61 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  30.39 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.89 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.03 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.25 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  30.99 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.06 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.99 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  30.99 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  36.57 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  32.57 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.41 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.86 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.61 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.16 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.16 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.16 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.25 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  36.57 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.52 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  36.57 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  36.57 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>