242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1291 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  60.2 
 
 		 294 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  52.74 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  54.45 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  51.86 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  53.74 
 
 		 291 aa  291  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  51.86 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  52.2 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  50.85 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  51.53 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  50.85 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  52.72 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  50.17 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  49.83 
 
 		 304 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  48.83 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  48.49 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  47.99 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  47.16 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  47.65 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  44.41 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  47.32 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  46.1 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  47.32 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  44.86 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  42.18 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  43.48 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  42.95 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  42.91 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  44.85 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  44.33 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  44.33 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  43.29 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  40.73 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  41.86 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  37.2 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  36.03 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  37.07 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40.73 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  36.61 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  37.54 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.52 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.04 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.61 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.82 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  35.93 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  40.96 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  40.96 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.88 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  34.78 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  34.24 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  39.6 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  39.32 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  37.83 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.67 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  37.79 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  41.61 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  41.61 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  40.26 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  40.13 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  39.2 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.27 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.72 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  38.13 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.21 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  38.64 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.75 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.75 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  36.75 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  36.63 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  36.86 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  32.89 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  37.12 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  34.01 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.55 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  34.65 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  32.01 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  36.45 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  35.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>