220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1262 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  52.97 
 
 
633 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  60.13 
 
 
656 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  55.63 
 
 
636 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  56.08 
 
 
634 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  53.96 
 
 
651 aa  663    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  57.33 
 
 
632 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  55.17 
 
 
637 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  57.86 
 
 
672 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  56.09 
 
 
668 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  59.06 
 
 
651 aa  702    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  78.08 
 
 
658 aa  984    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  56.51 
 
 
637 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  55.1 
 
 
637 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  100 
 
 
643 aa  1292    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  59.09 
 
 
630 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  55.77 
 
 
634 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  57.48 
 
 
666 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  58.8 
 
 
629 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  57.26 
 
 
632 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  53.15 
 
 
633 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  54.73 
 
 
641 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  57.99 
 
 
652 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  57.42 
 
 
634 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  52.65 
 
 
633 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  56.01 
 
 
668 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  60.45 
 
 
657 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  52.46 
 
 
633 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  59 
 
 
632 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  59.28 
 
 
640 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  53.96 
 
 
651 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  54.71 
 
 
633 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  53.57 
 
 
633 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  56.51 
 
 
630 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  53.96 
 
 
651 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  55.85 
 
 
670 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  52.32 
 
 
648 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  55.85 
 
 
569 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  51.4 
 
 
630 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  52.75 
 
 
633 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  50.65 
 
 
626 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  52.13 
 
 
634 aa  611  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  49.2 
 
 
664 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  49.28 
 
 
628 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  49.76 
 
 
628 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  48.94 
 
 
632 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  47.5 
 
 
620 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  48.95 
 
 
622 aa  602  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  49.52 
 
 
636 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  47.5 
 
 
620 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  49.19 
 
 
620 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  47.96 
 
 
622 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  51.39 
 
 
630 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  49.28 
 
 
638 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  48.86 
 
 
631 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  49.2 
 
 
630 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  48.27 
 
 
638 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  49.18 
 
 
621 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  49.2 
 
 
660 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  48.27 
 
 
688 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  49.2 
 
 
637 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  49.36 
 
 
637 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  48.27 
 
 
638 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  47.92 
 
 
628 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  49.2 
 
 
630 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  49.2 
 
 
630 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  49.2 
 
 
630 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  49.2 
 
 
630 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  49.2 
 
 
622 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.92 
 
 
627 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  48.37 
 
 
631 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  48.41 
 
 
638 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  48.87 
 
 
660 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  47.98 
 
 
620 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  48.13 
 
 
622 aa  592  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  50.16 
 
 
631 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  47.32 
 
 
648 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  49.76 
 
 
639 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.88 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  49.19 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  49.35 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  49.51 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  49.6 
 
 
656 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  47.96 
 
 
628 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  49.92 
 
 
624 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  48.53 
 
 
622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  47.03 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  46.76 
 
 
653 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  46.94 
 
 
622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  47.15 
 
 
622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  47.15 
 
 
622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  48.05 
 
 
634 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  47.57 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  47.57 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  48.79 
 
 
626 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  47.57 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  47.57 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  48.7 
 
 
647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  48.62 
 
 
634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  48.84 
 
 
644 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  48.06 
 
 
622 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>