More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1246 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  62.96 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  67.4 
 
 		 327 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  54.6 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 343 aa  354  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  54.83 
 
 		 331 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  41.74 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  39.76 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  40 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.61 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  34.37 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  39.3 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.6 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.44 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  39.47 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  39.47 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.86 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  33.03 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  37.34 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.69 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.22 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.2 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  38.33 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  35.93 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  31.49 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.6 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  32.74 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>