More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1062 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  100 
 
 
398 aa  813    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  77.94 
 
 
397 aa  617  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  74.25 
 
 
399 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  73.62 
 
 
398 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  74.12 
 
 
398 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  73.68 
 
 
398 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  75.94 
 
 
392 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  76.13 
 
 
391 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  76.13 
 
 
391 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  76.13 
 
 
391 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  72.61 
 
 
398 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  75.44 
 
 
392 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  73.12 
 
 
398 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  72.11 
 
 
398 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  75.69 
 
 
392 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  71.43 
 
 
412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  71.43 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  68.57 
 
 
421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  69.93 
 
 
426 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  68.81 
 
 
421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  68.33 
 
 
420 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  69.93 
 
 
426 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  68.94 
 
 
389 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  68.95 
 
 
412 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  70.62 
 
 
393 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  70.72 
 
 
394 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  68.09 
 
 
389 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  63.81 
 
 
426 aa  530  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  68.32 
 
 
393 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  65.58 
 
 
395 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
388 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
388 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  65.41 
 
 
395 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
388 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 
388 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  65.67 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
406 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 
402 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 
407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  60.58 
 
 
401 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
392 aa  421  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  53.65 
 
 
390 aa  419  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  51.01 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  55.72 
 
 
393 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  55.36 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 
395 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  55.08 
 
 
393 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  55.33 
 
 
393 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  54.48 
 
 
395 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  54.73 
 
 
393 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 
393 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  55.47 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  53.02 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  55.36 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  54.57 
 
 
403 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  54.06 
 
 
387 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  55.33 
 
 
393 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  53.13 
 
 
396 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  53.79 
 
 
387 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  53.42 
 
 
383 aa  391  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  54.73 
 
 
393 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  53.05 
 
 
383 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  52.88 
 
 
396 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  52.88 
 
 
396 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  53.54 
 
 
387 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  52.88 
 
 
396 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 
383 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  53.28 
 
 
385 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  51.78 
 
 
389 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  52.67 
 
 
385 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 
383 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 
383 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  53.15 
 
 
381 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 
383 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  53.05 
 
 
383 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  51.78 
 
 
382 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  51.52 
 
 
382 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1777  S-adenosylmethionine synthetase  51.15 
 
 
392 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  52.91 
 
 
399 aa  381  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  52.28 
 
 
383 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 
384 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 
384 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 
384 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  51.9 
 
 
384 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 
383 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  51.51 
 
 
396 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
384 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>