More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1059 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
550 aa  1074    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  53.68 
 
 
576 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  52.51 
 
 
567 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  44.98 
 
 
541 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  50.46 
 
 
556 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  52.79 
 
 
567 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  48.87 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  48.63 
 
 
540 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  45.38 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  44.02 
 
 
535 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  45.17 
 
 
536 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  51.86 
 
 
553 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  44.38 
 
 
536 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  51.16 
 
 
566 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  44.34 
 
 
536 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  43.51 
 
 
532 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  42.34 
 
 
534 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  44.7 
 
 
532 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  44.51 
 
 
532 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  41.87 
 
 
557 aa  359  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  42.1 
 
 
528 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  42.69 
 
 
534 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  41.83 
 
 
534 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  41.12 
 
 
543 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  34.7 
 
 
541 aa  300  5e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.34 
 
 
531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  36.38 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  36.38 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.96 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  38.04 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
537 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  35.59 
 
 
528 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.37 
 
 
495 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.45 
 
 
495 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 
472 aa  205  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  35.32 
 
 
508 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  38.19 
 
 
495 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
488 aa  191  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
573 aa  180  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.76 
 
 
509 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.14 
 
 
501 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.09 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
509 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  36.51 
 
 
509 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  33.11 
 
 
497 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  34.57 
 
 
487 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
512 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  30.67 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 
516 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 
505 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 
505 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
509 aa  163  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
529 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  32.47 
 
 
503 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.04 
 
 
503 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  28.96 
 
 
492 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
512 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  29.56 
 
 
512 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 
512 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
512 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.29 
 
 
506 aa  159  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.48 
 
 
510 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
519 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 
505 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
516 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 
506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.78 
 
 
523 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
512 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
512 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
515 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
512 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 
502 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 
528 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
507 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
524 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
532 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
588 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  33.69 
 
 
522 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
516 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.36 
 
 
519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.59 
 
 
518 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
520 aa  153  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.49 
 
 
525 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
510 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
521 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  31.57 
 
 
489 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
515 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
515 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
515 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 
513 aa  151  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 
537 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  32.74 
 
 
511 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
512 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>