More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1027 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 444 aa  904    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  61.26 
 
 		 442 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  56.21 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  52.71 
 
 		 440 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  55.2 
 
 		 472 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.99 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  47.43 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  43.82 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  47.74 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  41.8 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  43.3 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  42.26 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  45.62 
 
 		 432 aa  332  6e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.22 
 
 		 464 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  42.76 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  42.28 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  44.75 
 
 		 444 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  42.37 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.53 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  40.8 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.97 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.16 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  38.94 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  39.59 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.61 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 440 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  40.84 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 		 481 aa  262  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.18 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  39.47 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  39.15 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  38.11 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  41.25 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.83 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  33.81 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.6 
 
 		 476 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  29.02 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.79 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 445 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  39.52 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  39.52 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  39.52 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  39.52 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  39.52 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  39.52 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  38.1 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  37.3 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.9 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  38.52 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  32.23 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.35 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.76 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.32 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  31.93 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  31.25 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  23.19 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.55 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.96 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.02 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.78 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.9 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.9 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.54 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.9 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.43 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.18 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  27.16 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.38 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.54 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.22 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  27.22 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  22 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  31.75 
 
 		 574 aa  56.6  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  29.38 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  29.38 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>