More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0921 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  66.67 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  57.29 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  58.29 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  57 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  56.65 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  56.65 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  55.45 
 
 		 258 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  56.65 
 
 		 220 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  56.57 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 257 aa  197  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  53.27 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  51.02 
 
 		 199 aa  194  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  58.01 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.74 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  50.52 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  52.66 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  56.04 
 
 		 198 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.46 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.46 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  49.03 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  49.03 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.29 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  55.43 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  51.76 
 
 		 269 aa  184  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.49 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  56.35 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  52.2 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.64 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.55 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  50 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  50.5 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  55.67 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  55.68 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.5 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  51.24 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  55.56 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  54.75 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 248 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 253 aa  177  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.49 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  51.85 
 
 		 236 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  52.06 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  48.53 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  54.44 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 257 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>