More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0873 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  100 
 
 
331 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  71.34 
 
 
332 aa  482  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  71.34 
 
 
332 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  66.46 
 
 
329 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  64 
 
 
329 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  63.69 
 
 
329 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  64.62 
 
 
327 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
329 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  60.54 
 
 
332 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  47.24 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  47.26 
 
 
331 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  47.14 
 
 
327 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  45.42 
 
 
331 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  42.49 
 
 
319 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  42.62 
 
 
331 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  41.53 
 
 
319 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
319 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  38.67 
 
 
319 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
314 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  39.49 
 
 
316 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  34.53 
 
 
314 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
328 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  41.7 
 
 
324 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
349 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
311 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
341 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
326 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  35.26 
 
 
311 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.41 
 
 
326 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.41 
 
 
326 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  37.81 
 
 
319 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  38.41 
 
 
326 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.14 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.14 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  38.41 
 
 
326 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  37.14 
 
 
347 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.41 
 
 
326 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  38.08 
 
 
326 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.08 
 
 
326 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.09 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  36.08 
 
 
312 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.82 
 
 
311 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.97 
 
 
311 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
328 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  36.33 
 
 
327 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.78 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  36.91 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
317 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 
311 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 
311 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.19 
 
 
311 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
331 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  38.44 
 
 
330 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
319 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.33 
 
 
311 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  35.65 
 
 
328 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  36.7 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  38.33 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  36.5 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  35.86 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  38.28 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  39.27 
 
 
338 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
328 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  37.34 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
331 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  39.85 
 
 
325 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
325 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
317 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  37.2 
 
 
309 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
331 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  36.19 
 
 
340 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.07 
 
 
331 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  34.18 
 
 
317 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  35.89 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  37.78 
 
 
331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
324 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  34.48 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.18 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  34.64 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  31.53 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
312 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
312 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  35.13 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  36.77 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  36.95 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  35.86 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>