More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0859 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 716 aa  1463    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  60.14 
 
 		 774 aa  861    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  40.81 
 
 		 742 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 750 aa  502  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  38.85 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 757 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 730 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  57.29 
 
 		 378 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 		 772 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.93 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 733 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 714 aa  301  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 728 aa  287  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 708 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 728 aa  279  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 710 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 811 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 811 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 727 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 727 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 729 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 726 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 710 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 722 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 712 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.79 
 
 		 704 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.89 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.86 
 
 		 744 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 738 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 751 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 719 aa  234  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 737 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 754 aa  231  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 756 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 707 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 725 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 706 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 734 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 707 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 768 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 743 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 707 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.96 
 
 		 804 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.58 
 
 		 804 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 724 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 729 aa  221  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 726 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 753 aa  220  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 731 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.29 
 
 		 771 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 742 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 772 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 772 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.8 
 
 		 724 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.51 
 
 		 737 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 712 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 764 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 761 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 685 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 729 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.94 
 
 		 705 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  29.05 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 749 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  27.6 
 
 		 700 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 808 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 801 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 801 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 702 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 715 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 702 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 762 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 800 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 722 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 823 aa  197  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 802 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 708 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 698 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 709 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 819 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  34.44 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 777 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 809 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 729 aa  184  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 839 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>