61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0851 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  59.33 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  58.55 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  54.6 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  53.12 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  53.33 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  53.33 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  54.97 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  48.45 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  47.34 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  45.7 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  39.78 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  43.24 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  40.38 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  40.67 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  38.29 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  40.82 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  40.88 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  39.61 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  39.46 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  37.75 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  38.1 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  36.65 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  37.66 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  37.09 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  36.88 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  36.25 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  38.96 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  32.45 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  37.68 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  37.5 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  32.94 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  33.56 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  30.2 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  30.2 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  31.47 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  30.77 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  29.45 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  30.07 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.97 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  32.85 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  30.87 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  29.53 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.29 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  28.36 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  29.66 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  27.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  27.92 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  28.97 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  28.97 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  28.95 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  25.52 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>