227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0831 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  63.74 
 
 
198 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  61.7 
 
 
218 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  60.89 
 
 
213 aa  224  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  57.42 
 
 
216 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  54.88 
 
 
240 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  57.42 
 
 
216 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  53.33 
 
 
213 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  57.75 
 
 
255 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  56.7 
 
 
204 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  60.87 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  56.99 
 
 
202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  52.74 
 
 
210 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  56.04 
 
 
239 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  58.7 
 
 
201 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  56.04 
 
 
241 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  56.04 
 
 
241 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.94 
 
 
204 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.8 
 
 
227 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.38 
 
 
211 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.51 
 
 
226 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  55.91 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  56.68 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  56.35 
 
 
226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  48.02 
 
 
214 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  53.04 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  48.9 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  49.21 
 
 
216 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  48.62 
 
 
210 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  53.37 
 
 
209 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  45.61 
 
 
223 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  46.78 
 
 
223 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  44.38 
 
 
219 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  49.41 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  44.83 
 
 
208 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  44.83 
 
 
208 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  45.25 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  43.35 
 
 
211 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.52 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  44.07 
 
 
266 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  42.46 
 
 
270 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  45.31 
 
 
233 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.63 
 
 
237 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.46 
 
 
270 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.52 
 
 
227 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  42.18 
 
 
215 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  44.94 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  39.64 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  40.66 
 
 
195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.48 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  42.11 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  38.76 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  41.28 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  41.28 
 
 
201 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  41.28 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  39.53 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  42.86 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  44.58 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  44.58 
 
 
190 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  44.58 
 
 
211 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  41.9 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  39.05 
 
 
200 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  39.53 
 
 
205 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40 
 
 
196 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  39.78 
 
 
212 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  37.87 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  38.37 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  38.37 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  39.51 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  38.17 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.69 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  35.82 
 
 
208 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  40.48 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  40.48 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.88 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  34.91 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.88 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.88 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  38.95 
 
 
201 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.88 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.88 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.48 
 
 
218 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  39.79 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.1 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  38.1 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  38.46 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  38.1 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  40.48 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  39.53 
 
 
224 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  37.5 
 
 
225 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  38.2 
 
 
222 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  37.79 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  37.79 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.29 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>