48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0744 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  49.58 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  38.2 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  41.11 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  35.2 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  34.31 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  50.94 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.13 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  42.7 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  43.62 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  37.5 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  32.43 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  34.82 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  43.06 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  43.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  35.42 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  32.99 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  36.94 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  33.02 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  35.16 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  38.1 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  39.34 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  35 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  37.36 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  31 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  42.31 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  46.34 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  45.9 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  36 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  46 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  38.64 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  29.47 
 
 		 113 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  36.76 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  41.51 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  33.87 
 
 		 92 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  40.58 
 
 		 81 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  42.62 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  35.09 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  31.86 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>