22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0663 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  31.56 
 
 
349 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  35.57 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  31.69 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  30.32 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  33.53 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  50 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  42.86 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  31.21 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  46.55 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  34.94 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  49.18 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  30.98 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  45.76 
 
 
567 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  44.26 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  27.59 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  44.44 
 
 
189 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  44.44 
 
 
189 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  38.1 
 
 
188 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3865  hypothetical protein  45.95 
 
 
476 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  35.59 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>