More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0587 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1137    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  59.85 
 
 		 523 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  54.49 
 
 		 540 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  53.5 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  53.77 
 
 		 529 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  53.5 
 
 		 542 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  53.93 
 
 		 529 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  54.13 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  48.62 
 
 		 523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  48.74 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  49.21 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  48.14 
 
 		 505 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  48.21 
 
 		 506 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  48.41 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  46.67 
 
 		 507 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  46.94 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  43.14 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  42.94 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  41.83 
 
 		 509 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.68 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  41.1 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  43.37 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  37.07 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.87 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 		 362 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  37.82 
 
 		 360 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  36.41 
 
 		 365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  37.57 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 332 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 		 328 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  33.15 
 
 		 327 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 		 342 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 332 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  32.4 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 		 341 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 		 312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 		 345 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  47.22 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.75 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  29.06 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 		 346 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 		 348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  31.35 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 		 341 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 		 338 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 344 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  46.76 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  29.12 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  45.51 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  28.29 
 
 		 351 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  29.78 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 		 340 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 308 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  31.65 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  28.86 
 
 		 341 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 		 362 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  27.2 
 
 		 342 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 		 384 aa  103  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  30.41 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  27.22 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  27.51 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  27.66 
 
 		 345 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 		 333 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 		 344 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  28.65 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 		 361 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  46.62 
 
 		 165 aa  100  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  26.93 
 
 		 339 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  43.05 
 
 		 158 aa  100  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  53.33 
 
 		 161 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 		 387 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.66 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  26.51 
 
 		 361 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 		 331 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  26.91 
 
 		 329 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  45.69 
 
 		 161 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 341 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 		 323 aa  98.2  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  45.53 
 
 		 158 aa  98.2  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  27.81 
 
 		 348 aa  97.8  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 339 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  55.24 
 
 		 176 aa  97.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>