More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0576 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  82.56 
 
 		 560 aa  929    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  86.67 
 
 		 540 aa  961    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  85.74 
 
 		 540 aa  953    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  83.33 
 
 		 540 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  73.79 
 
 		 548 aa  849    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  82.56 
 
 		 539 aa  914    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 540 aa  932    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  84.07 
 
 		 540 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  85.37 
 
 		 540 aa  964    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  81.04 
 
 		 540 aa  886    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  74.63 
 
 		 548 aa  860    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  84.07 
 
 		 540 aa  933    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  86.11 
 
 		 540 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  74.58 
 
 		 545 aa  860    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  80.37 
 
 		 565 aa  900    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  84.97 
 
 		 540 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  82.41 
 
 		 540 aa  919    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  62.39 
 
 		 545 aa  707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  84.44 
 
 		 540 aa  962    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  82.22 
 
 		 541 aa  921    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  84.44 
 
 		 540 aa  933    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  85.37 
 
 		 540 aa  964    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  73.98 
 
 		 548 aa  853    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1107    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  53.26 
 
 		 543 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  53.43 
 
 		 545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 		 544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  53.22 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  50.37 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  52.04 
 
 		 543 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  52.51 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  43.82 
 
 		 668 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 663 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  42.03 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 663 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  41.48 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.75 
 
 		 709 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  42.16 
 
 		 672 aa  439  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.15 
 
 		 575 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.02 
 
 		 638 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.64 
 
 		 581 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.15 
 
 		 564 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  37.5 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  37.31 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.98 
 
 		 567 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 536 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.12 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 767 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.64 
 
 		 564 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.7 
 
 		 644 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  40.9 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.67 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.76 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  41.62 
 
 		 667 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.67 
 
 		 649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 645 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 		 641 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  41.56 
 
 		 574 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  38.42 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  39.3 
 
 		 649 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.33 
 
 		 643 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 656 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  42.46 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  39.09 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  40.67 
 
 		 619 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 643 aa  395  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 		 641 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.8 
 
 		 636 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.31 
 
 		 664 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  36.4 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.75 
 
 		 645 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  37.89 
 
 		 572 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.12 
 
 		 630 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.62 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.21 
 
 		 651 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.49 
 
 		 634 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 688 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 644 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.5 
 
 		 659 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  36.5 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 662 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 658 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 658 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  41.79 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 659 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 644 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  40.11 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 640 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.57 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  39.27 
 
 		 648 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  39.81 
 
 		 659 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.33 
 
 		 575 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>