32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0571 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  36.21 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  29.53 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  30.2 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  28.95 
 
 
240 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  29.49 
 
 
306 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  32.24 
 
 
221 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  29.05 
 
 
230 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  28.71 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  27.69 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  28.57 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  28.35 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  28.35 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  28.95 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  28.14 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  26 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  25.98 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  26.29 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  26.26 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  25.39 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  26.77 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  23.66 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  26.87 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  22.12 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  27.14 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  23.67 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  24.16 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  23.98 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  23.91 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>