More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0568 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  76.42 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  71.21 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  73.17 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  73.25 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  71.83 
 
 		 289 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  72.22 
 
 		 289 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  74.48 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  73.14 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.64 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  71.15 
 
 		 282 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  74.06 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  74.26 
 
 		 316 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  72.84 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  73.14 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  69.69 
 
 		 282 aa  348  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  67.05 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.5 
 
 		 268 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  71.25 
 
 		 254 aa  345  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  71.31 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  71.25 
 
 		 277 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  69.92 
 
 		 258 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  69.92 
 
 		 258 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  64.75 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  71.25 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  70.89 
 
 		 267 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  69.2 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  67.93 
 
 		 263 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  64.14 
 
 		 252 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  64.32 
 
 		 264 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  64.98 
 
 		 254 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  65.95 
 
 		 253 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  64.56 
 
 		 253 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  64.56 
 
 		 253 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  62.92 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  60.78 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  62.87 
 
 		 249 aa  309  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  62.08 
 
 		 241 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  61.67 
 
 		 241 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  63.36 
 
 		 244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  61.69 
 
 		 271 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  58.4 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.5 
 
 		 244 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  62.3 
 
 		 262 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  58.08 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  62.55 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  58.65 
 
 		 240 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 		 239 aa  292  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  56.76 
 
 		 262 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  56.76 
 
 		 262 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.96 
 
 		 244 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  58.69 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 249 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  58.33 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  59.36 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  61.73 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  59.83 
 
 		 253 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  57.09 
 
 		 261 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.75 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.17 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.17 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.17 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  60.08 
 
 		 241 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 		 262 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  61.51 
 
 		 239 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  55.68 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.67 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.14 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  56.44 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.17 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59.24 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 249 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 249 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.23 
 
 		 254 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  61.25 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58.7 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  59.11 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  56.55 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.66 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>