25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0517 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
327 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
867 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
3301 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  35.88 
 
 
356 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
856 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  35.85 
 
 
527 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  35.04 
 
 
450 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
316 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  25.23 
 
 
689 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  24.64 
 
 
689 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
1562 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  25.86 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  27.1 
 
 
916 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  28.38 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  26.17 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  30.07 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  26.04 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  23.58 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  24.88 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  26.56 
 
 
1364 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  23.96 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1771  hypothetical protein  25.43 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0716326  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
791 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>