More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0483 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
107 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  66.98 
 
 
106 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.04 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  64.15 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  58.49 
 
 
106 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.49 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
106 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
106 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  53.27 
 
 
107 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.21 
 
 
106 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  54.21 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  48.6 
 
 
110 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
117 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
140 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
122 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  47.17 
 
 
106 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
122 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
106 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
106 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
130 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  43.81 
 
 
120 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
127 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  44.95 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.23 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1530  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  43.64 
 
 
110 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  39.25 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  40.57 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.81 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  41.28 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.96 
 
 
118 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  41.51 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  42.2 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  43.4 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  37.38 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  39.62 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  41.82 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
125 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  39.05 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
116 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
120 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 
109 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  40.57 
 
 
110 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.89 
 
 
114 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  47.67 
 
 
113 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
206 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.32 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.46 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>