More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0444 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  71.11 
 
 		 270 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  59.34 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  62.73 
 
 		 295 aa  348  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  62.5 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  60.52 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  61.62 
 
 		 271 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  61.62 
 
 		 270 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  60.51 
 
 		 289 aa  341  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  60.51 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  60.15 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  61.4 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  60.75 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  58.3 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  59.04 
 
 		 269 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  59.41 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  58.09 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  59.41 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  57.93 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  58.09 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  59.41 
 
 		 269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  58.67 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  58.67 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  58.3 
 
 		 269 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  54.98 
 
 		 271 aa  313  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  55.72 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  55.02 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  55.35 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  55.76 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  52.77 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  53.87 
 
 		 262 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  53.51 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  51.09 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.61 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  51.66 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  51.85 
 
 		 285 aa  281  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  54.1 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  52.96 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  49.8 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  47.27 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.4 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  33.95 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.19 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  34.93 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  32.72 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  34.94 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  36.3 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  32.13 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  36.67 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  32.13 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  34.2 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  34.69 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  34.69 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  32.97 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  35.19 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  35.14 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  35.93 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  33.82 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  34.91 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  36.8 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  32.71 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  35.93 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  32.35 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  32.34 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  32.96 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  31.37 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  33.7 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  32.34 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  32.62 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  33.94 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  35.23 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  31.99 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  32.09 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  32.6 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  32.25 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  34.43 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  30.69 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>