More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0441 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1085 aa  2223  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
1094 aa  668  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  42.33 
 
 
3560 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 
4489 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 
3035 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 
700 aa  516  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
761 aa  471  1e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
909 aa  468  1e-130  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  44.2 
 
 
654 aa  461  1e-128  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
750 aa  459  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
732 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.02 
 
 
816 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 
618 aa  452  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  38.45 
 
 
740 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  41.47 
 
 
667 aa  422  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 
647 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  48.87 
 
 
492 aa  400  1e-110  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
739 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
808 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 
569 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  42.28 
 
 
574 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  46.53 
 
 
459 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
611 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
706 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  49.88 
 
 
452 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 
616 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
660 aa  353  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  39.38 
 
 
568 aa  344  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
750 aa  337  8e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  37.83 
 
 
560 aa  336  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 
570 aa  327  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  35.36 
 
 
680 aa  323  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  51.77 
 
 
295 aa  318  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  4.90816e-07  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 
672 aa  315  2e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  36.84 
 
 
632 aa  313  8e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  45.21 
 
 
395 aa  312  3e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  44.71 
 
 
566 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
708 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
632 aa  308  5e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  41.95 
 
 
657 aa  302  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
754 aa  302  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  40.66 
 
 
657 aa  299  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
754 aa  289  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  38.1 
 
 
590 aa  288  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  43.31 
 
 
637 aa  287  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
590 aa  286  1e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
828 aa  285  2e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  41.62 
 
 
633 aa  285  3e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
828 aa  284  6e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  41.56 
 
 
582 aa  273  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
789 aa  272  3e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
732 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
824 aa  271  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
828 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  40.25 
 
 
588 aa  266  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  34.91 
 
 
624 aa  266  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
833 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
717 aa  265  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  40.52 
 
 
630 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
968 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
717 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
718 aa  260  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.36 
 
 
739 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.63 
 
 
585 aa  257  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
833 aa  256  1e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.5 
 
 
1106 aa  257  1e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  28.2 
 
 
776 aa  253  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  28.2 
 
 
776 aa  253  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  28.2 
 
 
776 aa  253  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 
821 aa  253  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
821 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
776 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
1106 aa  252  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
776 aa  250  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 
715 aa  250  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.87 
 
 
708 aa  248  5e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
598 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1714 aa  237  1e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.17 
 
 
937 aa  234  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  49 
 
 
251 aa  232  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
619 aa  232  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.34 
 
 
742 aa  229  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  27.69 
 
 
790 aa  227  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 
699 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
647 aa  226  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 
790 aa  224  5e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
713 aa  224  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
626 aa  220  9e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.18 
 
 
739 aa  220  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
779 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.33 
 
 
739 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
693 aa  219  3e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 
529 aa  215  3e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 
780 aa  215  3e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
780 aa  215  3e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 
589 aa  215  4e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
627 aa  214  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
595 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.48 
 
 
781 aa  211  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
633 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>