More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0418 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  79.21 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  69.23 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  67.31 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  56.73 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  58.42 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.96 
 
 		 258 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.92 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.4 
 
 		 223 aa  104  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  50.98 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  63.73 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>