More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0403 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  100 
 
 		 378 aa  763    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0212  cysteine desulfurase  60.21 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.133802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  53.76 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.46 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  53.05 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.24 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  51.19 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  51.19 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.53 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.59 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  52.76 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.72 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  51.08 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 402 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  51.08 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  50 
 
 		 391 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  50 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  51.08 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50.54 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  49.06 
 
 		 388 aa  352  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  48.12 
 
 		 386 aa  352  8.999999999999999e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  50.53 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  51.19 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  48.26 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  48.12 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  49.47 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.3 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  48.68 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  47.44 
 
 		 402 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  48.95 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.38 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.72 
 
 		 394 aa  335  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1537  cysteine desulfurase  53.12 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.417733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1253  aminotransferase class V  53.12 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.83 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 387 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.38 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  47.58 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.89 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.03 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  49.08 
 
 		 387 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.71 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1412  aminotransferase class V  48.9 
 
 		 391 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.65 
 
 		 404 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.55 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.95 
 
 		 382 aa  322  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 392 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.65 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.28 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.51 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.43 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  45.55 
 
 		 402 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.9 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  51.61 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.33 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.24 
 
 		 392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.38 
 
 		 409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.55 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.36 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.8 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.82 
 
 		 414 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.71 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.15 
 
 		 1143 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.44 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.17 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.7 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  45.8 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  47.55 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.55 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.17 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  47.71 
 
 		 381 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.57 
 
 		 1139 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.12 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  44.69 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 1135 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  43.34 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.4 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  44 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>