More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0270 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  100 
 
 		 448 aa  904    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  61.57 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  62.39 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  61.8 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  64.01 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  61.57 
 
 		 449 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  61.35 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  64.35 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  62.92 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  58.05 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  60.97 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  63.28 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  63.64 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  62.19 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  62.44 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  57.51 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  61.5 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  59.56 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  57.84 
 
 		 442 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  54.22 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  56.76 
 
 		 446 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  58.05 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  58.05 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  52.91 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  54.34 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  53.49 
 
 		 442 aa  435  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  51.37 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  47.07 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  48.53 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  47.54 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  47.17 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  46.44 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  46.44 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  46.12 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  45 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  41.32 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  46.95 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  39.21 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  40.95 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  41.02 
 
 		 451 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  41.22 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  39.53 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  37.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.32 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.4 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.16 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.4 
 
 		 441 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.33 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.97 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.5 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.97 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 427 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  31.28 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.23 
 
 		 442 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  34.06 
 
 		 438 aa  216  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  33.8 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32.49 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.5 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  30.89 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.01 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.76 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.41 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.18 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.74 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.82 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.93 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.92 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.65 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31 
 
 		 430 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  31.2 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.16 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.93 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  32.57 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.95 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  29.95 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.24 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  30.1 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.93 
 
 		 434 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.62 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.69 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>