258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0131 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
251 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  66.37 
 
 
232 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  66.08 
 
 
244 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1520  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  64.6 
 
 
232 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1518  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  64.6 
 
 
232 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.28 
 
 
236 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0195  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.26 
 
 
243 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  62.34 
 
 
236 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.44 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.97 
 
 
235 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0340  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.58 
 
 
237 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0347  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.78 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.03 
 
 
235 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0357  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.35 
 
 
234 aa  241  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101317  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0333  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.21 
 
 
235 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.44706  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3540  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.68 
 
 
232 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.63 
 
 
293 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0668079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4588  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.35 
 
 
235 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_004310  BR2128  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.63 
 
 
238 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.25 
 
 
235 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.61 
 
 
232 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.197981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.16 
 
 
240 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0786  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.59 
 
 
241 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4325  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.48 
 
 
235 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.22 
 
 
240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4774  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.22 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  54.15 
 
 
230 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3989  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.22 
 
 
229 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  48.5 
 
 
234 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.98 
 
 
255 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0129  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.22 
 
 
241 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0638289  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0072  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.98 
 
 
232 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1987  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1094  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.45 
 
 
242 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.61 
 
 
234 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.914028  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.16 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0514  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  47.03 
 
 
243 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.944181  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.04 
 
 
277 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.41 
 
 
239 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0034827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.07 
 
 
232 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  44.05 
 
 
271 aa  168  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0025  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.56 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1461  orotidine 5`-phosphate decarboxylase  41.45 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0029  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.56 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.26 
 
 
244 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.74 
 
 
233 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000599953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1728  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.55 
 
 
245 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2797  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 
241 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0924  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.92 
 
 
238 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0883  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  45.29 
 
 
252 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.35 
 
 
232 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.35 
 
 
232 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0054  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.59 
 
 
241 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668833  normal  0.533949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1501  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.95 
 
 
231 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0645  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.68 
 
 
236 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0615  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.11 
 
 
232 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1532  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.68 
 
 
236 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1201  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.74 
 
 
236 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3424  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  45.65 
 
 
247 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.367397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02856  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.88 
 
 
233 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  39.33 
 
 
239 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.99 
 
 
232 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1355  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.31 
 
 
239 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000760656  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2664  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.45 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2569  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.63 
 
 
240 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.07 
 
 
234 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1662  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.97 
 
 
241 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000183413  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1676  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.63 
 
 
240 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.35 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.93 
 
 
242 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.04 
 
 
235 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02117  orotidine 5-phosphate decarboxylase  43.98 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000184829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.44 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.64 
 
 
451 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
234 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2141  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
238 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.15 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1335  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 
240 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2225  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.38 
 
 
234 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1328  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.49 
 
 
238 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.08 
 
 
243 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
243 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1380  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.59 
 
 
229 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.89 
 
 
235 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1547  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.11 
 
 
241 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3839  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.92 
 
 
246 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1093  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
235 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.55211  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.05 
 
 
233 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11890  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.36 
 
 
236 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000215744  normal  0.0186296 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0770  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.63 
 
 
230 aa  148  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1703  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.39 
 
 
243 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00220988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.59 
 
 
229 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1757  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.34 
 
 
231 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0566904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.79 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0374618  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0284  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
228 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1724  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.84 
 
 
227 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.297453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.54 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00305334  hitchhiker  0.00000000994876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>