More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0111 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  100 
 
 
348 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  71.86 
 
 
339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.57 
 
 
316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  51.53 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.92 
 
 
318 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.29 
 
 
318 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.79 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  53.67 
 
 
323 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.45 
 
 
318 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.46 
 
 
364 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  46.69 
 
 
351 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  50.67 
 
 
341 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  49.02 
 
 
347 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  44.84 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  48.46 
 
 
308 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  48.43 
 
 
347 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.15 
 
 
351 aa  263  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  44.71 
 
 
347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.32 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.19 
 
 
312 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.62 
 
 
343 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.08 
 
 
304 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.36 
 
 
478 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.51 
 
 
334 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  40.92 
 
 
389 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.69 
 
 
466 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.47 
 
 
415 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  47 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.79 
 
 
475 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.79 
 
 
452 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.83 
 
 
476 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  47.67 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  45.69 
 
 
424 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.53 
 
 
500 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  45.02 
 
 
457 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.83 
 
 
476 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.79 
 
 
384 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.7 
 
 
317 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  46.31 
 
 
453 aa  215  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  43.64 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.39 
 
 
458 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.87 
 
 
476 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.16 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  45.66 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.63 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.93 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  40.38 
 
 
411 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  38.57 
 
 
402 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  44.68 
 
 
406 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.43 
 
 
391 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.75 
 
 
415 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.43 
 
 
464 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.28 
 
 
386 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.81 
 
 
453 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  48.78 
 
 
488 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.57 
 
 
428 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  42.05 
 
 
369 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.54 
 
 
476 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.17 
 
 
471 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.92 
 
 
459 aa  209  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.49 
 
 
485 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  38.23 
 
 
459 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  38.37 
 
 
408 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.5 
 
 
513 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.67 
 
 
416 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.37 
 
 
408 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  43.12 
 
 
514 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  39.71 
 
 
372 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.75 
 
 
487 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  45.21 
 
 
388 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 
473 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  44.44 
 
 
472 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.86 
 
 
469 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  43.57 
 
 
402 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  46.54 
 
 
525 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.62 
 
 
327 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  43.57 
 
 
402 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  45.32 
 
 
411 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.32 
 
 
386 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.62 
 
 
405 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.04 
 
 
381 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.72 
 
 
476 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  37.89 
 
 
382 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44.53 
 
 
480 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.16 
 
 
482 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  41.03 
 
 
361 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  44.16 
 
 
387 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  43.66 
 
 
420 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  44.92 
 
 
474 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.88 
 
 
498 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 
503 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  43.23 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.16 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  45.82 
 
 
511 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  45.26 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  43.17 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.64 
 
 
385 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  46.09 
 
 
473 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.57 
 
 
404 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.64 
 
 
410 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>