17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0077 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  356  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  69.66 
 
 
179 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  47.16 
 
 
176 aa  168  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  46.89 
 
 
176 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  33.15 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  32.42 
 
 
202 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  31.89 
 
 
196 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  31.14 
 
 
275 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  31.71 
 
 
275 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  30.39 
 
 
197 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  30.39 
 
 
197 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  32.22 
 
 
195 aa  99  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  30.22 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1213  hypothetical protein  26.88 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0598646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  26.09 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>