44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0075 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  74.07 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  64.81 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  62.96 
 
 
65 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  70 
 
 
65 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  62.96 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  63.64 
 
 
59 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  63.64 
 
 
59 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  59.26 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  62.75 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  58.33 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  49.12 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  49.09 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  50.94 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  41.51 
 
 
131 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2025  hypothetical protein  64.29 
 
 
58 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  46.67 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  45.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  45.28 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1571  hypothetical protein  47.06 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.665593 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0554  hypothetical protein  42.11 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0552955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  39.62 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  36.92 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3174  hypothetical protein  41.82 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  44 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3137  hypothetical protein  44 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  38.78 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  44.19 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  42 
 
 
71 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0890  hypothetical protein  41.86 
 
 
58 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  41.82 
 
 
66 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>