More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0072 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  919    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.59 
 
 		 491 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03450  hypothetical protein  51.34 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  54.21 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.2 
 
 		 1007 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.68 
 
 		 1005 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  42.7 
 
 		 1007 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.59 
 
 		 1038 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  44.02 
 
 		 984 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.99 
 
 		 989 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  43.37 
 
 		 973 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.85 
 
 		 1032 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.72 
 
 		 961 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.94 
 
 		 990 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.38 
 
 		 1046 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.24 
 
 		 1025 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.5 
 
 		 990 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.28 
 
 		 995 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.62 
 
 		 990 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.88 
 
 		 983 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.74 
 
 		 1025 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.97 
 
 		 978 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 		 976 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.83 
 
 		 962 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 		 974 aa  289  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  39.4 
 
 		 973 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 999 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.38 
 
 		 999 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 		 1015 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.46 
 
 		 968 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  40.14 
 
 		 952 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.75 
 
 		 971 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  35.97 
 
 		 967 aa  250  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.7 
 
 		 1024 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1050 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  36.26 
 
 		 967 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  36.74 
 
 		 1050 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.83 
 
 		 1013 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 		 976 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.25 
 
 		 977 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 		 1052 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.19 
 
 		 1034 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  32.81 
 
 		 975 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.87 
 
 		 983 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.71 
 
 		 991 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 		 1022 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.34 
 
 		 976 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.52 
 
 		 966 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.66 
 
 		 945 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 1037 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 		 987 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.8 
 
 		 1009 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  35.32 
 
 		 1043 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.28 
 
 		 948 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 976 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1011 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.24 
 
 		 973 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 		 950 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.86 
 
 		 1031 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.79 
 
 		 984 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.12 
 
 		 947 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.2 
 
 		 1006 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.41 
 
 		 989 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  32.57 
 
 		 975 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 		 906 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.61 
 
 		 1050 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 		 1000 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  33.89 
 
 		 894 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 1015 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.87 
 
 		 1023 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.42 
 
 		 974 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  32.56 
 
 		 930 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  31.77 
 
 		 985 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  32.25 
 
 		 949 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 		 1023 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1014 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 		 1055 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1070 aa  186  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1061  hypothetical protein  46 
 
 		 203 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 944 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  30.66 
 
 		 1010 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  30.98 
 
 		 997 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 1028 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 		 997 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.23 
 
 		 977 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  32.2 
 
 		 993 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  31.59 
 
 		 996 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 		 1032 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 		 1024 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.71 
 
 		 995 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.17 
 
 		 1035 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  29.82 
 
 		 978 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.42 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 		 1020 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.21 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  26.89 
 
 		 727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  26.2 
 
 		 741 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.92 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  24.93 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>