More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0061 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  72.68 
 
 		 196 aa  275  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 191 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  75.81 
 
 		 191 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  63.64 
 
 		 187 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  54.95 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  43.11 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  30.23 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  31.95 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.95 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
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NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
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NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 600 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.37 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  25.93 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 363 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  50.98 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  25.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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