More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
859 aa  1724  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.4 
 
 
764 aa  583  1e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  44.7 
 
 
836 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.55 
 
 
890 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  44.13 
 
 
764 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
695 aa  462  1e-128  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  40.87 
 
 
825 aa  447  1e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  40.7 
 
 
808 aa  449  1e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  39.04 
 
 
727 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  38.79 
 
 
774 aa  419  1e-115  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  38.39 
 
 
803 aa  418  1e-115  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  40.83 
 
 
724 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  36.94 
 
 
719 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
778 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 
725 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  38.3 
 
 
1117 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.2 
 
 
1129 aa  354  3e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  37.72 
 
 
1306 aa  351  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  36.2 
 
 
961 aa  346  9e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
1065 aa  343  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  34.5 
 
 
822 aa  340  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  34.53 
 
 
978 aa  336  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
1245 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.05 
 
 
710 aa  328  2e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 
806 aa  329  2e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 
806 aa  329  2e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 
806 aa  329  2e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.02 
 
 
821 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.37 
 
 
761 aa  320  8e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
815 aa  320  8e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.44 
 
 
814 aa  311  3e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 
747 aa  311  3e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 
950 aa  310  6e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
830 aa  310  1e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  34.05 
 
 
752 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 
769 aa  304  5e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.75 
 
 
723 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.15 
 
 
710 aa  287  5e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
979 aa  286  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
975 aa  278  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 
714 aa  275  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 
811 aa  274  5e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
867 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.22 
 
 
643 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.22 
 
 
643 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 
722 aa  270  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
819 aa  270  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 
741 aa  266  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.74 
 
 
755 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.4 
 
 
727 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.94 
 
 
750 aa  264  5e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.9 
 
 
714 aa  263  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.9 
 
 
728 aa  263  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  35.24 
 
 
704 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.27 
 
 
654 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.51 
 
 
905 aa  261  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  33.79 
 
 
711 aa  260  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.42 
 
 
838 aa  260  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.84 
 
 
776 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.04 
 
 
712 aa  260  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 
751 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.26 
 
 
784 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.24 
 
 
727 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.68 
 
 
648 aa  258  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.38 
 
 
649 aa  258  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.52 
 
 
625 aa  256  1e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  32.15 
 
 
807 aa  255  2e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.41 
 
 
761 aa  255  2e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.5 
 
 
770 aa  255  2e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.86 
 
 
735 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.85 
 
 
739 aa  254  4e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  34.96 
 
 
691 aa  254  4e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
758 aa  254  4e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.49 
 
 
618 aa  254  5e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 
728 aa  253  8e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.62 
 
 
721 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 
723 aa  252  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 
806 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
758 aa  252  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 
668 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.12 
 
 
648 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 
712 aa  251  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.73 
 
 
640 aa  250  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 
643 aa  250  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 
734 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.73 
 
 
734 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.86 
 
 
640 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 
795 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.49 
 
 
775 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 
880 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.82 
 
 
833 aa  248  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  28.94 
 
 
744 aa  248  5e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.88 
 
 
817 aa  247  7e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  28.88 
 
 
701 aa  247  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.02 
 
 
720 aa  246  1e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.79 
 
 
730 aa  246  1e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.24 
 
 
732 aa  246  1e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.61 
 
 
763 aa  245  2e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  31 
 
 
712 aa  245  2e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 
683 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>