More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  100 
 
 		 178 aa  357  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  68.31 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  64.84 
 
 		 170 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  62.43 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  69.28 
 
 		 156 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  65.93 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  78.99 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  60.67 
 
 		 164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  61.96 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  57.51 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  74.59 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  73.98 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  73.98 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  72.13 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  76.23 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  76.23 
 
 		 193 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  69.92 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  73.77 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  61.96 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  73.17 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  72.95 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  71.31 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  72.22 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  72.95 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  59.55 
 
 		 300 aa  184  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  69.11 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  69.11 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  57.37 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  76.36 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  51.96 
 
 		 153 aa  177  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  58.19 
 
 		 170 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  69.17 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  62.41 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  62.79 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  58.99 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  64.75 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  65.29 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  57.92 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  57.35 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  62.1 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  43.82 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  63.11 
 
 		 201 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 148 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 		 225 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  45.08 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  46.28 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  32.96 
 
 		 230 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 240 aa  87.8  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.52 
 
 		 233 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  37.43 
 
 		 172 aa  84.3  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  39.25 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  35.63 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38.73 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38.73 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  36.91 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  31.89 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  35 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  32.95 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  36.52 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  32.96 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  34.58 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 238 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  42.57 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  29.61 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  34.53 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  35 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  39 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>