30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  286  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  67.44 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  59.05 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  62.64 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  37.23 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.57 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  37.23 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.16 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  36.61 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  40.22 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  41.76 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  41.3 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  35.24 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  35.87 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  36.45 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  39.73 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  36.79 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  33.65 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  36.17 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  32.69 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  26.97 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>