More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 572 aa  1114    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  53.08 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  45.03 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  42.26 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  39.64 
 
 		 600 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  43.87 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  45.8 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  48.58 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  42.11 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  44.73 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  40.95 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  40.77 
 
 		 582 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  42.31 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  40.77 
 
 		 582 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  43.14 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  43.14 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  41.32 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  42.92 
 
 		 504 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  43.47 
 
 		 574 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  40.16 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  42.19 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  42.48 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  41.36 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  42.8 
 
 		 577 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  38.79 
 
 		 494 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  42.95 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  42.52 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  38.4 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  43.45 
 
 		 611 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  38.66 
 
 		 629 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  42.4 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  41.46 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  41.59 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  42.4 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  39.78 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  39.34 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  42.25 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  41.47 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  41.07 
 
 		 659 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  41.07 
 
 		 659 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  39.05 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  40 
 
 		 585 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 546 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 667 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.16 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  41.88 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.14 
 
 		 490 aa  340  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  37.3 
 
 		 663 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  40.55 
 
 		 664 aa  336  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  40.47 
 
 		 661 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  37.82 
 
 		 516 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  37.97 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  37.61 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  37.61 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  37.61 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  40.28 
 
 		 661 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  37.39 
 
 		 516 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  37.39 
 
 		 516 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  37.76 
 
 		 516 aa  332  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  41.05 
 
 		 545 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 548 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 548 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.76 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  38.37 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  38.95 
 
 		 538 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  35.66 
 
 		 530 aa  329  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  39.41 
 
 		 602 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.34 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  37.88 
 
 		 694 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  38.8 
 
 		 573 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  39.56 
 
 		 603 aa  323  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  37 
 
 		 526 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  37.58 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  37.15 
 
 		 530 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  37.7 
 
 		 698 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  38.3 
 
 		 538 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  38.78 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  40.51 
 
 		 685 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  37.97 
 
 		 676 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  43.49 
 
 		 546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  38.88 
 
 		 691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  37.1 
 
 		 660 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  39.63 
 
 		 658 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  38.06 
 
 		 676 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.51 
 
 		 514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  37.78 
 
 		 556 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  38.8 
 
 		 580 aa  309  9e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  37.57 
 
 		 673 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  37.1 
 
 		 668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  34.85 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  37.97 
 
 		 676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  40.21 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  38.23 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>