221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30800 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  100 
 
 		 414 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  64.54 
 
 		 387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  60.68 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  60.68 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  59.03 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  60.68 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  56.19 
 
 		 447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  58.54 
 
 		 414 aa  342  8e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  45.11 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  53.64 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  40.97 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  39.12 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  31.9 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.13 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.85 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.32 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  32.22 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.9 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 464 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  29.33 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.99 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  32.61 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.76 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.03 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.65 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.99 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  32.61 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  27.58 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  30 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.58 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.58 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.58 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>