65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  38.08 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  35.48 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  34.15 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  33.99 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  39.39 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  32.65 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  32.37 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  35.97 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  33.23 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  36.57 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.06 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  26.32 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  36.29 
 
 		 552 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  35.71 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  30.63 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  35.85 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  35.25 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  32.19 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  29.2 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.3 
 
 		 746 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  24.83 
 
 		 632 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  43.14 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  27.54 
 
 		 632 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  23.33 
 
 		 650 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  29.23 
 
 		 631 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.61 
 
 		 851 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.78 
 
 		 746 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  29.93 
 
 		 883 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.1 
 
 		 730 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.32 
 
 		 763 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  25.21 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  30.83 
 
 		 600 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.61 
 
 		 763 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.61 
 
 		 763 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.93 
 
 		 763 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  26.55 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  29.93 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.25 
 
 		 764 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.25 
 
 		 764 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.25 
 
 		 764 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.34 
 
 		 719 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  29.46 
 
 		 638 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  30.15 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.67 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  33.04 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.67 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.53 
 
 		 696 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  24.62 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  30.22 
 
 		 638 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.79 
 
 		 639 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.89 
 
 		 806 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.55 
 
 		 695 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.45 
 
 		 738 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>