230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
440 aa  846  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.5 
 
 
449 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.71 
 
 
464 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  51.15 
 
 
434 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.85 
 
 
461 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  51.84 
 
 
436 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  50.82 
 
 
462 aa  357  2e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.76 
 
 
441 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.76 
 
 
450 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.76 
 
 
450 aa  352  6e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  52.36 
 
 
461 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.61 
 
 
447 aa  350  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  49.65 
 
 
453 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  52.53 
 
 
434 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  50.74 
 
 
451 aa  343  3e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  52.38 
 
 
463 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  50.12 
 
 
422 aa  338  2e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  51.39 
 
 
446 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  50.51 
 
 
429 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.54 
 
 
436 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  53.71 
 
 
437 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.59 
 
 
442 aa  327  4e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
414 aa  322  1e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.66 
 
 
436 aa  319  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  51.54 
 
 
432 aa  309  7e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  45.03 
 
 
429 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
539 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 
402 aa  273  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  45.01 
 
 
408 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  43.26 
 
 
413 aa  266  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.67 
 
 
404 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  44.21 
 
 
442 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
391 aa  259  5e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
389 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
389 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
389 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.75 
 
 
391 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
389 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.31 
 
 
424 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.08 
 
 
389 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.05 
 
 
389 aa  255  1e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  43.77 
 
 
401 aa  255  1e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.56 
 
 
394 aa  254  2e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
409 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.28 
 
 
391 aa  253  4e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
431 aa  253  4e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  47.18 
 
 
436 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.23 
 
 
394 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.31 
 
 
389 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  44.16 
 
 
390 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.05 
 
 
389 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 
382 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.92 
 
 
400 aa  246  7e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.34 
 
 
391 aa  244  2e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.97 
 
 
391 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.39 
 
 
396 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 
433 aa  242  8e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.01 
 
 
390 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.03 
 
 
391 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.97 
 
 
391 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.63 
 
 
391 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.05 
 
 
382 aa  234  2e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.9 
 
 
383 aa  234  2e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.45 
 
 
397 aa  234  2e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.01 
 
 
399 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.38 
 
 
398 aa  233  4e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  38.4 
 
 
386 aa  233  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.23 
 
 
399 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  38.69 
 
 
472 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 
382 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.63 
 
 
395 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.81 
 
 
444 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.79 
 
 
425 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.27 
 
 
464 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.55 
 
 
406 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  38.92 
 
 
401 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 
392 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.58 
 
 
388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.58 
 
 
388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 
391 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.58 
 
 
388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.58 
 
 
388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.58 
 
 
388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.37 
 
 
400 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  40.14 
 
 
392 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.54 
 
 
395 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 
397 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
399 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.15 
 
 
389 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.9 
 
 
389 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  37.05 
 
 
451 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  37.05 
 
 
436 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.34 
 
 
397 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.55 
 
 
393 aa  222  1e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  37.59 
 
 
455 aa  221  2e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 
396 aa  221  2e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 
398 aa  220  4e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 
394 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  37.41 
 
 
402 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.34714e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>