57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  894    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  74.94 
 
 		 445 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  71.69 
 
 		 442 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  59.95 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  58.63 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  56.32 
 
 		 440 aa  441  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  52.14 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  53.61 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  47.17 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  53.57 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  46.72 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  42.21 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  43.3 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  29.41 
 
 		 583 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.27 
 
 		 737 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.36 
 
 		 589 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.89 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  30.98 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  27.13 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  28.31 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  25.57 
 
 		 604 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  29.08 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  29.5 
 
 		 693 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  25.86 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  27.45 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.33 
 
 		 612 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  27.46 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.04 
 
 		 548 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  29.11 
 
 		 567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  25.06 
 
 		 658 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  23.89 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  28.12 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  28.33 
 
 		 727 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  27.38 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  25.06 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  27.59 
 
 		 597 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  25.76 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  26.86 
 
 		 413 aa  96.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.88 
 
 		 636 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.83 
 
 		 631 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.3 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  25.36 
 
 		 574 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  25.94 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  22.62 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  25.27 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  24.88 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  24.94 
 
 		 850 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  20.89 
 
 		 1172 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  25.07 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  24.74 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  21.77 
 
 		 938 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.23 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  30.25 
 
 		 675 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.86 
 
 		 701 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.25 
 
 		 674 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  25.66 
 
 		 892 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>