More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  669    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  48.67 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  47.94 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  47.13 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  45.1 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  46.34 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  46.2 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  43.24 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  44.05 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  43.5 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  44.64 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  42.32 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  43.95 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 362 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  43.61 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  41.52 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  42.52 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  39.05 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  41.72 
 
 		 372 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  40.42 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  41.86 
 
 		 342 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  39.7 
 
 		 357 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  37.99 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  38.79 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  38.39 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  41.12 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  37.58 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.92 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.06 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  41.25 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.64 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  34.34 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  37.18 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.66 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  34.64 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.24 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  34.42 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  34.13 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  34.12 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  34.13 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  34.13 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  34.13 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  34.13 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  34.22 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  33.83 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  34.13 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.94 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0508  LacI family transcription regulator  35.51 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000735974 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  34.25 
 
 		 328 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.83 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>