69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  100 
 
 		 494 aa  990    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  48.9 
 
 		 804 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  54.53 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  49.57 
 
 		 789 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  48.82 
 
 		 703 aa  442  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.98 
 
 		 707 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  44.38 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  44.1 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  43.45 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.15 
 
 		 810 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 		 1112 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  35.99 
 
 		 1121 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 		 1121 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 1143 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 		 1121 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  35.14 
 
 		 848 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.15 
 
 		 1174 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  28.29 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  29.05 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.12 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  29.01 
 
 		 331 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.2 
 
 		 334 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.92 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.25 
 
 		 355 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.1 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.17 
 
 		 341 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.97 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.97 
 
 		 356 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  33.46 
 
 		 491 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  32.48 
 
 		 598 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.84 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.86 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.27 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.6 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 315 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.98 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.73 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.31 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.52 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.6 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  38.39 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.08 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.72 
 
 		 829 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 505 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  27.19 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 		 699 aa  46.6  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.8 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.69 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  26.88 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.63 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  21.82 
 
 		 324 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  31.87 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 636 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  23 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 519 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>