More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 434 aa  877    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  37.44 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  36.19 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  29 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  34.59 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.65 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  32.69 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.86 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.06 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.61 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  29.94 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.68 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.79 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  30.21 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.25 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  29.38 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  31.29 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.44 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.6 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.62 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.4 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.76 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.69 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.07 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.18 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>