262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28230  adenosine deaminase  100 
 
 
441 aa  870    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  44.14 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  44.27 
 
 
358 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  41.18 
 
 
373 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  42.96 
 
 
375 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  44.58 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  42.89 
 
 
372 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  43.19 
 
 
367 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  40.23 
 
 
367 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  39.34 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  39.86 
 
 
364 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  40.81 
 
 
360 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  40.38 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  42.62 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  39.08 
 
 
362 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  38.39 
 
 
362 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1218  adenosine deaminase  39.34 
 
 
378 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000911946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  38.39 
 
 
362 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  38.16 
 
 
362 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  38.67 
 
 
360 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  38.48 
 
 
362 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  37.53 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  38 
 
 
363 aa  259  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  40.14 
 
 
369 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  38.85 
 
 
362 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  38.72 
 
 
364 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  40.38 
 
 
367 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  41.84 
 
 
358 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  38.02 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3954  adenosine deaminase  38.14 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  36.74 
 
 
364 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  36.85 
 
 
365 aa  236  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  37.85 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  35.51 
 
 
366 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  33.49 
 
 
374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  33.64 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  33.41 
 
 
376 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  33.41 
 
 
376 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  30.02 
 
 
393 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  28.79 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  33.02 
 
 
359 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  27.59 
 
 
332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  30.68 
 
 
334 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  30.68 
 
 
334 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  26.65 
 
 
332 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  26.62 
 
 
331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  27.04 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  28.84 
 
 
332 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  28.37 
 
 
333 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  27.78 
 
 
332 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  34.7 
 
 
332 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  29.31 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  28.13 
 
 
333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  24.88 
 
 
344 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  29.41 
 
 
346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  28.64 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  28.4 
 
 
333 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0440  adenosine deaminase  31.31 
 
 
332 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  27.44 
 
 
333 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  27.34 
 
 
337 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  26.67 
 
 
331 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  26.67 
 
 
331 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  27.66 
 
 
353 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  26.97 
 
 
337 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  26.9 
 
 
331 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  23.88 
 
 
332 aa  123  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  27.51 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  28.5 
 
 
334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  27.14 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  26.67 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  26.67 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  26.97 
 
 
337 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  27.27 
 
 
334 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  26.97 
 
 
337 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  26.67 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  25.66 
 
 
341 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  26.82 
 
 
346 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  28.5 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  26.43 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  25.95 
 
 
331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  26.43 
 
 
331 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  25.66 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  24.94 
 
 
682 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  24.94 
 
 
682 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  25.42 
 
 
341 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  26.16 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  26.49 
 
 
332 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>