More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 
568 aa  1175    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  50.72 
 
 
554 aa  571  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  49.46 
 
 
552 aa  559  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.43 
 
 
557 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  49.28 
 
 
584 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  36.25 
 
 
563 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.42 
 
 
527 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.02 
 
 
550 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  34.6 
 
 
525 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  34.6 
 
 
525 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  34.6 
 
 
525 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.7 
 
 
556 aa  329  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34.41 
 
 
529 aa  329  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.77 
 
 
533 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  33.27 
 
 
527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.42 
 
 
545 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.57 
 
 
572 aa  301  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 
518 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  33.33 
 
 
532 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  31.72 
 
 
583 aa  287  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  31.65 
 
 
528 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.21 
 
 
540 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  33.4 
 
 
531 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  33.53 
 
 
531 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 
534 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.92 
 
 
531 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.54 
 
 
524 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  32.93 
 
 
559 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.88 
 
 
534 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 
565 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.32 
 
 
586 aa  257  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.97 
 
 
521 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  30.89 
 
 
554 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  31.5 
 
 
531 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  30.32 
 
 
538 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  32.87 
 
 
521 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  33.08 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
579 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.26 
 
 
467 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  29.42 
 
 
532 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
535 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 
546 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  28.19 
 
 
534 aa  206  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
536 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  28.44 
 
 
527 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  28.9 
 
 
532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
534 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  29.98 
 
 
502 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.12 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
470 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  27.41 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 
516 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.78 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 
516 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.72 
 
 
520 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 
523 aa  160  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
572 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  27.67 
 
 
517 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  25.43 
 
 
513 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  25.69 
 
 
484 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  25.69 
 
 
484 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  25.69 
 
 
484 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  25.83 
 
 
484 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  24.86 
 
 
484 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  25.1 
 
 
484 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 
484 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  24.86 
 
 
484 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  24.86 
 
 
484 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  24.4 
 
 
451 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  23.12 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  23.63 
 
 
459 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  23.83 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  22.61 
 
 
459 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  22.92 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.62 
 
 
457 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.23 
 
 
456 aa  106  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  23.71 
 
 
452 aa  104  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  24.95 
 
 
465 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.84 
 
 
470 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 
462 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
453 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3322  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 
471 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00350215  normal  0.0147191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.96 
 
 
459 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  22.22 
 
 
461 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.06 
 
 
459 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.63 
 
 
470 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  25.44 
 
 
506 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.4 
 
 
471 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  22.22 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  24.62 
 
 
461 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.74 
 
 
459 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.01 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.69 
 
 
467 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.05 
 
 
463 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.58 
 
 
462 aa  93.6  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  28.37 
 
 
461 aa  94  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  33.51 
 
 
463 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.41 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>