111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  45.15 
 
 
276 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  44.62 
 
 
270 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  44.49 
 
 
268 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  43.15 
 
 
257 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  44.98 
 
 
238 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  39.51 
 
 
266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  40.6 
 
 
412 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  38.02 
 
 
368 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  41.99 
 
 
323 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  39.21 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  36.82 
 
 
556 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  39.57 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  43.13 
 
 
234 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  37.77 
 
 
249 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.9 
 
 
521 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  35.45 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  38.99 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  39.32 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  33.03 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  34.08 
 
 
298 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  35.78 
 
 
192 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  35.04 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  35.1 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  33.77 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  32.93 
 
 
353 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  38.32 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  33.97 
 
 
286 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  39.82 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.23 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.62 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  38.02 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  38.02 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  38.03 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.53 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  32.74 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  34.51 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  30.57 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  41.11 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  34.87 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  35.77 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  33.13 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.35 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  27.15 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  27.71 
 
 
291 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  32.89 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  28.14 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  34.07 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.54 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  32.2 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.37 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  40.58 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.03 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  23.94 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  24.3 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  24.3 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  28.93 
 
 
327 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  39.71 
 
 
301 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  39.33 
 
 
302 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  30.43 
 
 
377 aa  52.4  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  31.68 
 
 
350 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  31.06 
 
 
216 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  32.97 
 
 
298 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  32.76 
 
 
308 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  26.81 
 
 
269 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.09 
 
 
206 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  29.08 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.37 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.09 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.33 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.43 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  30.77 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.02 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.86 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.09 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.83 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.86 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.25 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.29 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  27.56 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  25.52 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  23.32 
 
 
336 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  25.17 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  32.32 
 
 
208 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  32 
 
 
263 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  33.04 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  31.73 
 
 
214 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  25.69 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  32.11 
 
 
188 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  30.65 
 
 
320 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  29.85 
 
 
316 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  31.25 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  26.39 
 
 
286 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  22.43 
 
 
210 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>