43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1019    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  35.45 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  35.51 
 
 		 490 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  36.29 
 
 		 487 aa  256  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  33.2 
 
 		 490 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  30.33 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  31.69 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  29.98 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  29.53 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  27.76 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  26.8 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  27.83 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  28.48 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  28.6 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  30.21 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  30.56 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  28.06 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  27.35 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  25.31 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  25.66 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  29.11 
 
 		 489 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  28.31 
 
 		 484 aa  126  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  27.1 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  25.25 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  26 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  24.84 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  24.57 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  23.06 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  25.43 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  25.79 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  26.58 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.92 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  26.72 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  25.47 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  25.46 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  24.3 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  24.77 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  22.96 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  29.32 
 
 		 176 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  22.43 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  22.43 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  22.43 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  23.66 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>