180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 
448 aa  912    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  38.9 
 
 
440 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 
449 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
449 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
451 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
450 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 
448 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 
424 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  34.84 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
450 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
447 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 
432 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 
544 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  33.55 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 
453 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
452 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  34.34 
 
 
452 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  33.58 
 
 
452 aa  230  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 
457 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  36.16 
 
 
448 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  32.17 
 
 
452 aa  224  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  32.34 
 
 
464 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  33.98 
 
 
464 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  33.09 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  32.15 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 
498 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 
448 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 
462 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 
447 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 
455 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  31.28 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 
466 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
436 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  31.05 
 
 
442 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 
447 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
427 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
419 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
429 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.14 
 
 
435 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.43 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.58 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 
431 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
442 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.59 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  33.03 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
419 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 
480 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
420 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
423 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
420 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 
414 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.36 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
434 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.25 
 
 
439 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>