130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 369 aa  716    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  46.8 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  46.59 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.58 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  44.53 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.6 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  44.93 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  44.5 
 
 		 398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  47.17 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  44.44 
 
 		 361 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  43.26 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.78 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  38.87 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  40.12 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  39.88 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  39.59 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.7 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.4 
 
 		 409 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.18 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.83 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  34.99 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  38.03 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.01 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  37.8 
 
 		 340 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  37.24 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  37.78 
 
 		 368 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  39.69 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  36.15 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  38.51 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.2 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  38.2 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.2 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  36.48 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.17 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  35.21 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  36.45 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  44.36 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  28.9 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.02 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.5 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.52 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.51 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  29.82 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.22 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  29.47 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  22.91 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  22.91 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.97 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.8 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.56 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.88 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.32 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.49 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  26.22 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.44 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  25.91 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  29.15 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.14 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  29.47 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.69 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  25.07 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.4 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.23 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.31 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.23 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  29.12 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  26.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  27.8 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.03 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.72 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.61 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.18 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1782  hypothetical protein  25.68 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000345252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  26.2 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.2 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.27 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.81 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.39 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  26.85 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  27.48 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  23.75 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  25.09 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.08 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1823  folate-binding protein YgfZ  26.72 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1918  folate-binding protein YgfZ  25.62 
 
 		 310 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.16 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1862  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.171418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  25.16 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.79 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.41 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  25.66 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  36.45 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.41 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  28.52 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.84 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.74 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1876  folate-binding protein YgfZ  30.87 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0515526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  31.82 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.81 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>