40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 
253 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  57.2 
 
 
282 aa  254  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  52.76 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  50.58 
 
 
260 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  53.85 
 
 
269 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  52.07 
 
 
263 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  54.13 
 
 
256 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  53.72 
 
 
256 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  48.4 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  50 
 
 
273 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  46.72 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  49.15 
 
 
242 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  47.22 
 
 
269 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  45.32 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  51.67 
 
 
437 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  45.12 
 
 
277 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  45.63 
 
 
256 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  44.44 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  48.39 
 
 
259 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  45.63 
 
 
255 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  45.68 
 
 
296 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  43.95 
 
 
258 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  43.6 
 
 
264 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  46.09 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  46.28 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  42.91 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  48.79 
 
 
259 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  48.79 
 
 
259 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  44.73 
 
 
241 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  45.49 
 
 
259 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  44.72 
 
 
268 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  44.72 
 
 
268 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  41.1 
 
 
302 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  44.03 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  32.58 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  38.24 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22110  hypothetical protein  36.17 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  34.41 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  31.73 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  36.36 
 
 
255 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>