More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 585 aa  1132    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  46.38 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  47.45 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  44.94 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 563 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.33 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  42.67 
 
 		 603 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  38.49 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  36.77 
 
 		 563 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  33.82 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 546 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 550 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  36.19 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  36.15 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 566 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  39.23 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.19 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  37.28 
 
 		 540 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.53 
 
 		 548 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.04 
 
 		 642 aa  220  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.04 
 
 		 642 aa  220  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.19 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.15 
 
 		 634 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 551 aa  216  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.9 
 
 		 600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  31.93 
 
 		 632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  40.25 
 
 		 563 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 629 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.16 
 
 		 672 aa  211  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 644 aa  211  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 548 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  28.24 
 
 		 636 aa  211  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 515 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  29.18 
 
 		 642 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 515 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  30.11 
 
 		 630 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  31.44 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.02 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 641 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  28.34 
 
 		 658 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.86 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.13 
 
 		 634 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  28.39 
 
 		 644 aa  204  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  33.64 
 
 		 615 aa  203  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.56 
 
 		 620 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.19 
 
 		 690 aa  203  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  27.86 
 
 		 879 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  35.48 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.15 
 
 		 709 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.34 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.21 
 
 		 646 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  36.53 
 
 		 537 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  27.95 
 
 		 642 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.11 
 
 		 644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 		 643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.94 
 
 		 636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  30.62 
 
 		 565 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  31.82 
 
 		 545 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  28.49 
 
 		 642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  30.09 
 
 		 653 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  32.16 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 659 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  29.86 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  33.77 
 
 		 618 aa  197  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  28.39 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.91 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  30.15 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  29.03 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  29.03 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.46 
 
 		 649 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  29.87 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  29.44 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 644 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 658 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 658 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 658 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  28.28 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  28.52 
 
 		 639 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 658 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  29.62 
 
 		 632 aa  194  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 656 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 		 544 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 		 559 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 662 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  30.84 
 
 		 548 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 		 555 aa  193  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  31.19 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.47 
 
 		 668 aa  193  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  35.05 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  27.73 
 
 		 528 aa  193  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  27.64 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.56 
 
 		 641 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  33.39 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  27.72 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  27.55 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  29.44 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>